- โต๊ะที่วางอุปกรณ์ที่มั่นคงเพื่อวางกล้องจุลทรรศน์ให้ได้อยู่ในระนาบเดียวกัน
- วางกล้องจุลทรรศน์ลงบนโต๊ะ เพื่อมีพื้นที่ในการทำงาน
- วางตัวอย่างไว้ตรงกลางของพื้นที่ใต้กล้องจุลทรรศน์
- เปิดชุดไฟส่องลงหรือส่องขึ้นให้พอเหมาะ
- ปรับระยะห่างระหว่างตาให้ทั้งสองตา มองที่เลนส์ตาให้เห็นเป็นวงกลมตรงกลางเป็นวงเดียว
- เลื่อนตัวอย่างให้อยู่ในตำแหน่งที่ผู้ใช้ต้องการ
- ปรับกำลังขยายที่หัวกล้องจุลทรรศน์ ตามกำลังขยายที่ต้องการและปรับไฟส่องขึ้นหรือส่องลงให้เหมาะสมกับตัวอย่าง
- ปรับระยะการทำงานที่อาร์มด้านหลังของหัวกล้องจุลทรรศน์จนได้ภาพคมชัดตามที่ต้องการ
- เนื่องจากกล้องสเตอริโอเป็นภาพชนิดแบบสามมิติ จึงจะต้องปรับหา focus ตามระนาบที่ผู้ใช้ต้องการ
